Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip10Q8CJ53 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms