Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nupl2Q8CIC2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms