Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp11Q8CFF0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms