Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc28bQ8CEG5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc28bQ8CEG5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms