Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms