Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph6aQ8CDR2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms