Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lrrc9Q8CDN9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms