Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms