Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ufl1Q8CCJ3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms