Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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