Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrrn3Q8CBC6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms