Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spef2Q8C9J3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms