Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C5C9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8C5C9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8C5C9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8C5C9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms