Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms