Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FarsaQ8C0C7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FarsaQ8C0C7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms