Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka5Q8C050 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka5Q8C050 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms