Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms