Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor1Q8BX46 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms