Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms