Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PcgF3Q8BTQ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcgF3Q8BTQ0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms