Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.4 ms