Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp8Q8BMJ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp8Q8BMJ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp8Q8BMJ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp8Q8BMJ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sp8Q8BMJ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sp8Q8BMJ8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp8Q8BMJ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp8Q8BMJ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms