Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tspan12Q8BKT6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms