Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabra5Q8BHJ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra5Q8BHJ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms