Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a7Q8BGY9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a7Q8BGY9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms