Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg4dQ8BGV9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4dQ8BGV9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms