Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cyp4f39Q8BGU0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms