Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Vipas39Q8BGQ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Vipas39Q8BGQ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Vipas39Q8BGQ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Vipas39Q8BGQ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Vipas39Q8BGQ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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Vipas39Q8BGQ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vipas39Q8BGQ1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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