Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af1l4Q8BGJ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms