Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg4bQ8BGE6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg4bQ8BGE6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms