Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGB5

Limd2, LIM domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd2Q8BGB5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Limd2Q8BGB5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Limd2Q8BGB5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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