Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms