Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt12Q8BG71 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms