Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sptlc3Q8BG54 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptlc3Q8BG54 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms