Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnb1Q8BG40 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms