Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pld4Q8BG07 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms