Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms