Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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ChfrQ810L3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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ChfrQ810L3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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ChfrQ810L3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ChfrQ810L3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ChfrQ810L3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ChfrQ810L3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChfrQ810L3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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