Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cracr2bQ80ZJ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms