Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300.8 ms