Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ell3Q80VR2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms