Protein–RNA interactions for Protein: Q80V62

Fancd2, Fanconi anemia group D2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2Q80V62 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fancd2Q80V62 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fancd2Q80V62 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fancd2Q80V62 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms