Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Avl9Q80U56 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms