Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna12Q80SS5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna12Q80SS5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ifna12Q80SS5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms