Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdc42bpbQ7TT50 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms