Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Clec18aQ7TSQ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Clec18aQ7TSQ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec18aQ7TSQ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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