Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmQ7TSN2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmQ7TSN2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms