Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnkQ7TSL0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnkQ7TSL0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms