Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PhkbQ7TSH2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PhkbQ7TSH2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms