Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms